PLATAFORMAS DISPONíVEIS

  • Sequenciamento automático de DNA
  • Eletroforese em Gel 2D
  • Espectrometria de Massas Bioinformática

LINHAS DE PESQUISA

  • Estudos de Fatores de Virulência em Vibrio Cholerae
  • Estudos da Interação Proteína-DNA na Regulação da Expressão Gênica
  • Mecanismos de Reparo de DNA
  • Seqüenciamento e Anotação Genômica da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicu
  • Modelagem de Estruturas Proteínas por Homologia: Desenvolvimento de um ambiente computacional para análises em larga escala.
  • Analise Proteômica da bactéria Gluconacetobacter diazotrophicus
  • Analise Proteômica da bactéria Vibrio Cholrae em diferentes condições fisiológicas.
  • Analise Proteômica diferencial de células humanas infectadas com o vírus da Dengue
  • Analise Proteômica em Leucemia Mielóide Crômica LMC
  • Proteoma de Expressção Diferencial da via Fanconi.

ESTUDOS MULTIDISCIPLLNARES DE GENÔMICA, PROTEÔMICA E BIOLOGIA ESTRUTURAL

A Unidade Multidisciplinar de Genômica foi criada em 2001 com o objetivo de catalisar, dentro do Programa de Biologia Molecular e Estrutural, o desenvolvimento de novos métodos de Genômica e Pós-Genômica, propondo a ampliação e reorientação do Laboratório de Fisiologia Celular, até então dirigido pelo agora Professor Emérito Darcy Fontoura de Almeida.

A Unidade tem a função, dentro do Instituto de Biofísica, de criar e desenvolver uma visão estratégica para a análise integrada de processos biológicos, contando com uma organização ímpar para atingir estes objetivos: um coordenador geral responsável pela organização do funcionamento da unidade e pela integração com outros grupos e uma equipe de pesquisadores permanentes desenvolvendo trabalhos de ponta em suas áreas.

A equipe permanente conta, atualmente, com um pesquisador emérito, dois professores adjuntos e três técnicos. Estão alocados ainda diretamente na unidade um pós-doutorando e cinco alunos e pósgraduação, além de vários estagiários de iniciação científica. Pela sua natureza, a unidade é também utilizada sistematicamente por integrantes dos projetos colaborativos e por outros membros e alunos do Instituto de Biofísica que utilizam as suas facilidades. Atualmente, a unidade participa ativamente em três projetos colaborativos do Estado do Rio de Janeiro patrocinados pela FAPERJ: o Instituto Virtual de Bioinformática e Modelagem de Biossistemas, o projeto de sequenciamento genômico Riogene, com um sequenciador da rede instalado na unidade, e da Rede de Proteômica do Rio de Janeiro, com um espectrômetro de Massa MALOI-TOF e um equipamento de eletroforese 2D também instalados na unidade.

A unidade conta ainda com uma extensa colaboração em projetos de Biologia Estrutural com o Laboratório de Física Biológica do IBCCF e o Centro Nacional de Ressonância Magnética Nuclear de Macromoléculas, instalado no Instituto de Ciências Biomédicas da UFRJ, ambos com suporte do programa de grupos de excelência PRONEX e atualmente integrados no Instituto do Milênio de Biologia Estrutural em Biomedicina e Biotecnologia.

As linhas de pesquisa desenvolvidas pela equipe permanente da unidade concentram-se no estudo da expressão e regulação gênica de bactérias, dando continuidade aos projetos anteriores. São abordados os seguintes temas: estudo de genomas e proteoma de bactérias, particularmente as patogênicas, por técnicas de biologia molecular e da bioinformática, estudos da interação ONA-proteína no contexto da regulação gênica de bactérias e a análise de regiões extragênicas de bactérias e de sua funcionalidade na regulação.

A rede Rio-Gene realiza, atualmente, o sequenciamento do genoma da Gluconacetobacte diazotrophicus, bactéria fixadora de nitrogênio da cana de açúcar, sendo que a unidade participa tanto nas etapas de sequenciamento automático, como na área de bioinformática com anotações e predição de estruturas. Além de garantir o funcionamento do espectrômetro de massa para toda a rede de proteômica, a unidade está mais intimamente envolvida em dois projetos sobre o estudo de proteômica comparativa, um envolvendo cepas de Vi brio cholera com diferentes graus virulentos e outro sobre a bactéria Gluconacetobacter crescidas em diferentes condições de disponibilidade de nitrogênio. Novos projetos estão sendo iniciados na área de estudos proteômicos de doenças humanas, destacando-se o papel destas técnicas no desenvolvimento de métodos diagnósticos e prognósticos do câncer.

Equipe

Chefe de Laboratório
Paulo Mascarello Bisch

Docentes
Ana Beatriz F. Pacheco
Wanda Maria de Almeida von Kruger

Técnicos
Camila Bayer
Lilian Ayres Sá

PROGRAMA: 
Unidades Multidisciplinares